孵化中心孵化场在牡丹江科技大厦1—4层，现有孵化面积4000平方米，其中企业用房3000平方米。为企业准备了办公、科研及生产用房，拥有洽淡室、会议室、展销厅、资料室、培训教室等设施；设有商务印刷中心，为企业提供电话、传真、打字、复印、材料装订等项服务；提供安全保卫、环境卫生、生产生活用水、用电、取暖等综合性后勤保障。两年来中心投资5万元对办公室、恰谈室进行了重新装修，更新了办公桌椅，公示板上墙。孵化中心对在孵企业与重点项目给予减免房租、免费使用网络等优惠措施，为入孵企业减轻负担。中心制定了《牡丹江市高新技术孵化器建设实施方案》，规范了孵化企业流程和入驻、毕业企业标准，完善了各项管理制度，并经常对职工进行教育和培训，使职工素质明显提高，提高了对企业的服务能力和水平。

中心积极探索新的经营机制，提高中心自身的经济效益。孵化中心采取在孵化企业中占股份的运作模式进行操作，孵化中心对入驻孵化的企业，均占有 10%无形资产股，孵化企业毕业后每个企业都按年纯润10%的比例向中心交纳科技风险基金，使中心孵化资金每年都有增加，为中心的自身发展奠定了基础。